微生物生态研究的一个重要目标，就是确定微生物群落是如何形成和散布以及它们是如何互动的。但在全球范围内，想要评估这些特征需要使用大量数据集。
地球微生物组计划希望通过开放合作的科学手段，记录细菌及古菌在全球的分布，从而进一步了解决定群落结构的自然法则。人们早已知道细菌是所有生物中数量最多的一类;而古菌很可能就是最古老的生命体，尽管与细菌有很多相似之处，但在基因上与细菌不同，存在重复序列与核小体这点更与真核生物类似。
此次在项目一期，美国加州大学圣地亚哥分校研究人员卢克·汤普森及其同事，展示了对微生物群样本的元分析，这些样本由全球各地上百名研究人员采集。他们分析了27751份来自土壤、水、动物及植物栖息地的样本，并对样本进行核糖体RNA(rRNA)基因测序，最终获得22亿个DNA测序读数。
这项研究以开放合作的方式，揭示了群落形成的规律及特定有机物的全球分布，使人类对微生物如何分散及移植到生态位有更深的理解。除此之外，该数据还为未来微生物生态学的进一步研究提供了非常重要的参考和架构。